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<?php date_default_timezone_set("America/Lima");?>
window.onload=hora; 
fecha = new Date("<? echo date("d M Y G:i:s"); ?>");
function hora(){ 
var hora=fecha.getHours();

var minutos=fecha.getMinutes(); 

var segundos=fecha.getSeconds();

if(hora<10){ hora='0'+hora;} 
if(minutos<10){minutos='0'+minutos; } 
if(segundos<10){ segundos='0'+segundos; } 
fech=hora+":"+minutos+":"+segundos; 
document.getElementById('hora').innerHTML=fech;
fecha.setSeconds(fecha.getSeconds()+1); setTimeout("hora()",1000); }
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<title="reloj">
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<div id="hora">
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